Le stanze dell'hotel, tutte confortevoli e luminose, dispongono di ogni comodità, ampie cabine armadio, cassaforte elettronica, linea cortesia completa di tutti gli accessori, bagno privato, asciugacapelli, TV a colori, telefono in camera e aria condizionata. Nel prezzo della camera è inclusa anche la prima colazione.

Villa Margherita propone un numero limitato di camere permettendo così agli ospiti di godere sempre e comunque della propria intimità e del fascino discreto che pervade l'albergo.

A seguito del restauro, la Villa ha pensato anche alle esigenze di chi viaggia per lavoro e per questo le camere sono tutte dotate di Internet, Wi-Fi, di comode scrivanie o tavolini di lavoro.